现在在我们已完全掌握了水源的特性基础上，对原水进行合理的预处理成为系统运行成功与否的关键。一般的预处理过程包括：澄清或石灰软化，多级过滤器如多介质过滤器、软化器、活性炭过滤器、保安过滤器及微孔过滤器，保安过滤器后还会设置紫外线杀菌器（UV）以消除细菌的滋生。正确的分析和认真的中试将可避免许多因预处理不合格而引起的麻烦。预 处理阶段的所有过滤器或软化器的容器须作衬胶处理或采用耐腐蚀的材质，以减少陶氏反渗透膜和陶氏纳滤膜进水中的铁离子含量。
实践证明，较保守的设计通常使系统运行更好，且能增强对水质波动的适应性。尽管保守的设计带来初期投资费较高但其长年累月的总运行成本减低，成功的经验表明，投资费和运行费应综合考虑，合理的保守设计所造成的较高的投资费是有价值的。表1列出在陶氏反渗透膜和陶氏纳滤膜预处理过程中常见设备的合理设计数据。
表1预处理设备设计参数
一个合理的预处理设计方案应充分考虑到陶氏反渗透膜的清洗频率。表2的标准将指导您评估陶氏反渗透膜和陶氏纳滤膜预处理的效果。
表2预处理评估准则
投加化学药剂也会影响预处理，对于澄清及过滤时添加的阳离子混凝剂、絮凝剂一定要严格控制，谨防过量。如果混凝剂和絮凝剂添加量合理，它们会在澄清或过滤过程中随污泥排出，但若投加过量，残余溶解状混凝剂和絮凝剂就会附着在膜表面造成陶氏反渗透膜的污染。另外还有一个问题是，当阳离子混凝剂与阴离子阻垢剂相遇，时常会发生反应，产生沉淀并污染陶氏反渗透膜元件。如果采用NaHSO3对原水作除氯处理，它的投加点应在整个预处理流程中尽可能靠后，通常位于保安滤器前，预处理过程中的pH值也应该严格控制，因为它们会影响絮凝和氯化杀菌效果。
