陶氏反渗透膜不是万能的，有以下4点做不到。
1、全量过滤
普通过滤通常为物料完全垂直通过过滤介质达成过滤，当使用陶氏反渗透膜时，不允许有机物或盐分透过膜，如果采用全量过滤将导致膜的表面因这些物质的富集而产生堵塞和污染。为防止在陶氏反渗透膜表面污染物的累积，在进水流道侧引入冲刷流动方式，这种过滤方式称为错流过滤，反渗透系统总是将进水分成两股水流，即被膜所截留的含浓缩溶质的浓缩液和透过膜面得到净化的透过液。
2、极限浓度
自然渗透过程中，水分子会从纯水侧透过半透膜迁移到高浓度的溶质侧以平衡溶液的强度。针对陶氏反渗透膜而言，最后平衡点水压称为该溶液的渗透压。溶液的渗透压取决于溶质的种类和浓度，随着进水不断被浓缩，就需要克服更高的溶液渗透压，这样也就需要施加更高的进水压力迫使水分子透过陶氏反渗透膜，由于膜面上的压力和溶质溶解度的极限之故，每一种溶液具有比较大的实际允许运行浓度。
3、过量的悬浮物质
高悬浮物（不溶物）含量的进料将迅速污染陶氏反渗透膜，需设置合适的预处理以优化这类进料的预处理过程。这时在反渗透膜前通常要设置超滤或微滤。
4、绝对分离
虽然陶氏反渗透膜是非常精细的液体过滤过程并能分离很小的溶质，但仍不能制造出理想和完美的反渗透膜，溶质脱除率取决于膜材料等，虽然可以实现99.99%脱盐率，但是要达到100％的分离要求是不现实的。
