培养法
水中细菌的浓度与该水源生物污染可能性是有直接关系的，细菌总数（TBC）是水样中已有微生物总数量的定量表示值，用陶氏膜过滤一定量的水样来确定细菌总数。将截留在陶氏膜表面的生物组织，置于一定的营养物中进行培养，形成菌落，通过低倍放大镜就可以观察到并对菌落进行计数。
这一方法的主要优点是无需昂贵的仪器设备就可以进行，但是测定结果要等到7天之后才能得出，被计数的菌落也仅为实际活微生物总量的1~10%左右。然而，培养技术仍然是表示微生物污染可能性程度和趋势的有效方法。它可以用于观察陶氏膜进水、浓水和产水中的情况。如果陶氏膜浓水中总细菌数增加，就表明膜元件内出现了生物膜污染。
直接细菌计数
直接计数技术采取先过滤水样，然后在显微镜下直接对截留在陶氏膜上的微生物进行计数。为了使得微生物能够观察到，需要对微生物用沙黄进行着色，然后在透光荧光显微镜下进行计数。
这样陶氏膜需要过滤的原水总微生物的准确数量就可以立刻获得，微生物的类型可以从沉积颗粒上进行区分。但是细胞组织的死活情况就无法进行区分要采用INT技术。
生物膜检测
未经处理的原水、陶氏膜装置进水和浓水中的微生物含量是评估潜在陶氏膜生物污染的重要指标。但其它因素如营养成份的浓度和种类、操作参数也决定了生物膜的发展，目前人们还没有充分认识清楚生物膜，实际系统操作过程中，定期仔细地检查预处理系统以及进水和浓水管内表面，也是有效的做法，当出现粘泥和异味时就表明有陶氏膜的微生物污染。
